实验方案概览¶
本节包含黄实验室空间转录组技术的详细标准操作流程（SOP）。
RCA 实验方案（按样本类型）¶
- RCA（新鲜冷冻组织） — 新鲜冷冻组织切片标准方案（v5.3）
- RCA（FFPE） — 福尔马林固定石蜡包埋样本，含脱蜡和修复步骤（v1.0）
扩增后步骤¶
- 测序与成像 — 原位测序循环、形态学染色（DAPI/WGA）及 H&E 染色
试剂配制¶
- 胃蛋白酶溶液 — HCl 稀释及胃蛋白酶工作液配制
- WGA-488 染色 — 麦胚凝集素染色用于细胞分割
- PDMS 制作 — PDMS 基底用于玻片上微量体系反应
实验流程¶
- 样本制备： 冷冻切片（FF）或 脱蜡处理（FFPE）
- 预处理： 固定、透化、封闭
- 文库构建： 探针杂交、连接、滚环扩增
- 信号读出： 原位测序（SPRINTseq）或 荧光成像（PRISM）
- 后续处理： 形态学染色（DAPI/WGA）、H&E 染色