实验方案¶
本节包含黄岩谊课题组空间转录组技术的详细标准操作流程(SOP)。
初次接触空间转录组?
建议先阅读 技术概览 了解完整工作流程,再进入具体实验方案。
RCA 实验方案(按样本类型)¶
以下为核心文库构建方案,请根据样本类型选择:
| 方案 | 样本类型 | 说明 |
|---|---|---|
| RCA(新鲜冷冻) | 新鲜冷冻 (v5.3) | 冷冻切片组织标准方案 |
| RCA(FFPE) | FFPE (v1.0) | 福尔马林固定石蜡包埋样本,含脱蜡和修复步骤 |
扩增后步骤¶
| 方案 | 说明 |
|---|---|
| 测序与成像 | 原位测序循环、形态学染色(DAPI/WGA)及 H&E 染色 |
免疫荧光¶
| 方案 | 样本类型 | 说明 |
|---|---|---|
| 免疫荧光(冷冻切片) | 新鲜冷冻 (v1.0) | RNA检测后或独立免疫荧光染色方案 |
试剂配制¶
各 RCA 方案引用的试剂配制指南:
- 胃蛋白酶溶液 -- HCl 稀释及胃蛋白酶工作液配制
- WGA-488 染色 -- 麦胚凝集素染色用于细胞分割
- PDMS 制作 -- PDMS 基底用于玻片上微量体系反应
参考资料¶
- 物料清单 (BOM) -- 完整试剂列表,含货号和供应商信息