Huang Lab Spatial Workshop

开源空间转录组技术，从实验台到数据分析。

黄岩谊课题组 | 北京大学 | BIOPIC & ICG

可直接上台操作的实验方案、完整的分析代码和可复现的工作流 -- 服务于 PRISM 和 SPRINTseq 两种基于挂锁探针的空间转录组技术。

开始使用 查看实验方案

2项技术 5+份 SOP EN/ZH双语 100%开源

技术平台

两种方法，共享一套流程 -- 仅在读出步骤分化。

• PRISM

  ---

  基于颜色-强度条形码和半径矢量编码的**单轮**高多重空间 RNA 成像。常规显微镜即可实现 64 重检测。

  探索 PRISM

• SPRINTseq

  ---

  基于混合分块编码的快速、抗信号拥挤**原位测序**。单个脑切片靶向转录组分析仅需 9.5 小时。

  探索 SPRINTseq

内容概览

{ style="border-bottom: none; padding-bottom: 0;" }

• 可上台操作的 SOP

  ---

  不仅仅是论文中的"方法"部分 -- 包含精确试剂体积、温度和时间的分步操作流程。

  查看方案

• 物料清单

  ---

  完整的试剂列表，含货号、供应商和配制指南。

  查看 BOM

• 分析流程

  ---

  从原始图像到表达矩阵 -- 配准、点检测、解码和分割。

  查看分析

• 故障排除

  ---

  来自多年实验室经验的常见问题真实解决方案。

  查看 FAQ

项目状态

本文档处于积极开发阶段 (v1.0-alpha)。协议正在数字化和验证中。欢迎贡献！